1.被保存的菌種必須是經18小時以上培養時間的新鮮純培養物。
2.菌種的保存最好使用配製3-4麥氏比濁度的菌懸液，若濃度過低會影響複蘇效果。
3.菌種保存時要上下顛倒，使細菌乳化、混勻，充分的吸附在小瓷珠上，不可旋搖，這樣不利於菌懸液混勻。
4.用無菌移液器將菌種保存管內的液體吸取幹淨，妥善放置吸出液體。
5.有條件的話可放在-70℃保存，若在-2—-8℃保存要一個月重新傳代一次以保證菌種有無變異性，連續傳代5次的菌種不能使用。
6.不要將菌株反複凍存，低溫會使水分形成冰晶導致細菌的損傷，反複凍存冰晶會變大，對菌株造成極大的損傷。
7.做厭氧菌保存時應提供厭氧環境，使用厭氧包、厭氧箱等。
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