真酵母的有性繁殖是產生子囊孢子。子囊孢子的生成，或者經兩酵母菌細胞的結合（有性結合），或者不經過兩性細胞的結合而行孤雌生殖孤雌生殖：某些種類的酵母菌，如啤酒酵母等，首先在細胞 內，核進行一定數目的分裂，一般是2，4或8個。然後分裂的子核外圍包有一部分細胞質，生出細胞壁，形成子囊孢子，原來的母細胞的細胞壁，即成為子囊。成熟以後，子囊破裂，釋放出子囊孢子。如遇環境適宜，子囊孢子可萌發成新的酵母菌營養細胞。
有性結合：某些種類的酵母菌，如八孢裂殖酵母等，兩個性別不同的單倍體營養細胞接近，各伸出一根管狀突出物，而後相互接觸。接觸處的細胞壁溶解，形成一個通道，兩細胞質融合即質配。兩核各自向通道移動，融合核配成二倍體的核。兩個細胞形成一個合子。這種二倍體細胞和單倍體細胞一樣，也可以獨立存在，進行出芽繁殖。在合適的條件下，二倍體核進行分裂，其中有一次為減數分裂，染色體減半後形成2，4或8個子核。每個子核的周圍包有細胞質並生出細胞壁，形成孢子，即子囊孢子。而原來的合子細胞即成為子囊。成熟後，子囊破裂，釋放出子囊孢子。子囊孢子為單倍體，在適宜條件下，可萌發成新的酵母菌營養細胞。
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