耶爾森氏菌屬屬於好氧或兼性厭氧發酵型革蘭氏陰性杆菌下的腸杆菌科。
直杆菌到球杆菌，直徑0.5~0.8μm,長1~3μm。無芽孢。不形成莢膜，但在 37°C生長或來自體內樣品的細胞中的鼠疫耶爾森氏菌(Y.pestis)能產生包被。革蘭氏陰性。37°C時不運動。生長在30°C以下時以周生鞭毛運動。鼠疫耶爾森氏菌總是不運動。在普通的營養培養基上生長。在營養瓊脂上培養24h後，菌落半透明到不透明，直徑0.1~1.0mm。最適生長溫度28~29°C。兼性厭氧，既具有呼吸型代謝又具有發酵型代謝。氧化酶陰性，接觸酶陽性。除了個別的生物變型(biovars)外，都能還原硝酸鹽成亞硝酸鹽。發酵葡萄糖和其他碳水化合物產酸，但不產氣或產少量的氣。表現特征常常與溫度有關，一般培養在25~29°C比在37~39°C能呈現出更多的特征性。所研究過的種具有腸杆菌的常見抗原。生境很廣泛（從有生命到無生命），有些種適應於特異性寄主。DNA的G+Cmol%為46-50(Tm, Bd)。種間鑒別見表3-18。
模式種：鼠疫耶爾森氏菌(Yersiniapestis)。
