黴菌的繁殖能力很強，而且方式多樣，或者是菌絲頂端不斷延伸，或者由菌絲的斷片重新生長出菌絲體。然而黴菌主要是通過產生各種無性孢子和有性孢子來達到繁殖目的的。
1、無性繁殖
黴菌的無性繁殖是指不經過兩性細胞的結合而形成新個體的過程。這是黴菌的主要繁殖方式。無性繁殖所產生的孢子稱無性孢子。無性孢子通常有 以下幾種
（1）芽孢子 .
芽孢子和酵母菌的出芽一樣，是 由母細胞生芽而形成的。當芽長到正常大小時，脫離母細胞，或仍連在母細胞上，如玉蜀黑粉菌能產生芽孢子。某些毛黴或根黴在液體培養基中形成的“酵母型細胞”，也屬芽孢子。
（2）節孢子
某些真菌生長到一定階段，菌絲中間形成許多隔膜，接著從隔膜處斷裂成許多竹節似的無性孢子，稱為節孢子，也稱為粉孢子。最典型的例子是白地黴。
（3）厚垣孢子
厚垣孢子又稱厚壁孢子或厚膜孢子。某些真菌生長到一定階段，在菌絲的頂端或中間有部分細胞的細胞質密集在一起，變圓，然後在其四周生出厚壁，或原細胞壁加厚，形成圓形、紡錘形的無性休眠體，來抵抗外界不 良的環境條件，如總狀毛黴常在菌絲中間形成許多厚垣孢子。
（4）孢囊孢子
無性繁殖產生的孢子在孢子囊內，稱為孢囊孢子。孢子囊一般生在氣生菌絲 的頂端或生在孢囊梗的頂端。在形成孢子囊前，首先有多核的原生質密集於此處，使其膨大，並在下方生出橫隔，形成圓形的囊狀物，然後其中原生質體割裂成許多小塊，每一塊發育成為一個孢囊孢子。因而每一個孢子囊所含有的孢囊孢子的數目一般都相當多。
就孢囊孢子而言，一般有兩種類型。一種具有一根或二根鞭毛，能夠遊動，所以稱遊動孢子，如腐黴。另一種無鞭毛，不能遊動，又稱靜止孢子，毛黴目的孢囊孢子即屬此類 。
（5）分生孢子
分生孢子是真菌中最常見的一類無性孢子。有的生在氣生菌絲或分支的頂端，有的生在分生孢子梗的頂端或側麵。其形成方式有兩種：一種是在分生孢子梗的頂端突出，發育成第一個孢子。梗再伸長形成第二個孢子，如此重複，形成一串孢子。這樣形成的分生孢子，頂端的最老。曲黴屬和青黴屬的分生孢子形成，即屬於此類型。另一種是在第一個分生孢子形成時，柄的長度已達到最高，由第一個分生孢子頂端生長出第二個分生孢子，如此重複形成一串孢子。這樣形成的分生孢子，下部的最老，如枝孢黴屬的分生孢子形成即屬於此類型。
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