酸解法除已披露的日本不二油脂株式會社外，大都使用於實驗室。這種方法不符合現代綠色生產的要求。它的弱點是投資大，工藝複雜，環境汙染大，工藝很難控製，生產的大豆多肽分子分布不均，極不穩定，產品質量也不穩定，生理功能很難確定。
堿解法據已披露的信息，基本都用於實驗室。在實驗室用於其他蛋白質的降解，分子量分布和氨基酸組成較好，但沒有發現用於工業化生產。
電解法目前隻見到理論文章，近來有披露和發現以此法生產大豆多肽的報道。
微生物發酵法目前我國有企業投資幾個億，用此法生產大豆多肽，這種大豆多肽分子量分布在3000以上，也屬於大豆多肽。因多肽分子量在5000間～1000間都屬於多肽範疇。但離大豆寡肽、小肽、微肽的活性、易吸收性、生理活性距離很大，所以，價格也很便宜。
酶解法酶解法使用的酶不同、酶的選擇與配方不同、酶解的大豆蛋白質不同，所獲得的大豆多肽的品質、分子量分布和氨基酸組成也大不相同。特別是製得的大豆多肽的生理功能也大不相同。目前酶法生產的大豆多肽，使用的動物酶有：胃蛋白酶、胰蛋白酶、細菌蛋白酶、黴菌蛋白酶；植物酶有：菠蘿蛋白酶、無花果蛋白酶、木瓜蛋白酶等等。隨著科技的發展和生物酶技術的創新，還有很多酶將被不斷發現和利用。用單純的胰酶生產的大豆多肽有腥味和苦味；用胰酶和其他酶配方，要弄清配方中各種酶的特性、相互作用等，否則生產的大豆多肽達不到質量要求。
（來源： S--三農在線-中國畜牧獸醫報）
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