人類之所以對深海極端環境下的微生物有如此巨大的研究興趣，除了其在探究生命起源、進化和外星生命是否存在方麵有重要意義外，從更現實的角度上看，破解極端微生物生理生化特性及其產生的原因，從而開發特殊的基因與產物，可為工業、農業、環境、能源、人類健康的發展提供新的方向，為現代生物技術帶來革命性進步。
例如，極端微生物的酶和代謝產物已成為生物技術創新的源泉之一，並已經創造了財富。1969年從美國黃石國家森林公園火山溫泉中分離的嗜熱菌產生的TaqDNA聚合酶，使DNA的體外複製變得異常簡便，大大加快了生物工程、基因重組等分子生物學研究的進程，年銷售利潤達到上億美元。在石油開采和濕法冶金領域，極端微生物可以發揮巨大作用。一般石油開采的采出率隻有30%~40%，將具有分解石蠟能力的嗜熱、耐壓、嗜鹽、厭氧菌的培養物與水，或菌劑與營養物及水一同注入油井中，可使石油采出率增加50%。在環境保護方麵，工業廢水一般是酸性、堿性或含鹽量大，隻有合適的極端微生物才能夠分解其中可能造成環境汙染的物質，淨化水質。
極端微生物能夠適應環境的多樣性，說明它們早已解決了科學家今天仍在尋找答案的那些問題，對它們的研究開發，將為緩解資源、環境壓力，保障社會可持續發展提供有效途徑，因此深海極端微生物成為當今科學家關注和研究的重點。隨著生物學及其他科學和技術的不斷進步，將為深海極端微生物的研究提供更好的條件，會進一步促進深海極端微生物的研究和發展。
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